Приоритетными направлениями научно-практической деятельности доктора Буйденка являются изучение и внедрение методов и систем для длительного введения лекарственных препаратов при лечении злокачественных заболеваний у онкологических больных. Ведущий специалист в области имплантации систем хронического сосудистого доступа у онкологических больных. Имеет самый большой личный опыт в РФ в этой области (имплантировал более 3000 венозных портов). Так же имплантирует порт-системы в брюшную полость и порты для артериального введения противоопухолевых химиопрепаратов. Проводит обучение технике имплантации порт-систем в России и в странах содружества в рамках обучающего курса и выездных мастер-классов.
Следует отметить большую научно-практическую деятельность доктора Буйденка. Ему принадлежит разработка, внедрение и усовершенствование методики длительного сосудистого доступа у онкологических больных, локальной интраперитониальной гипертермии в сочетании с интраоперационной химиотерапией, изолированной гипертермической химиоперфузии и инфузии при саркомах и меланомах конечностей. Впервые в РФ он внедрил метод возврата эритроцитов, получаемых из теряемой крови во время операций с массивной кровопотерей у онкологических больных. Разработал специальные методы фильтрации, позволяющие полностью удалять опухолевые клетки из возвращаемых больному эритроцитов. Результаты этих научных исследований включены в работу «Хирургическое лечение сочетанных онкологических и сердечно-сосудистых заболеваний», удостоенную Государственной премии РФ в области науки и техники в 2001 году.
Автор более 150 публикаций в российских и зарубежных научных изданиях и 3 монографий.